|
EL USO DE RFLPs EN EL ESTUDIO
DE POBLACIONES DE Phytophthora infestans
Greg Forbes.
Centro Internacional de la Papa (CIP) - Quito.
El tizón
tardío, causado por Phytophthora infestans
(Mont.) de Bary, es la más importante enfermedad de la
papa. P. infestans también causa enormes
pérdidas en otros cultivos de la familia Solanaceae,
como el pepino dulce y el tomate de árbol, y ataca a
varias especies silvestres. El manejo de esta
enfermedad depende de muchos factores, entre los cuales
se incluye la alta capacidad que tiene el patógeno para
adaptarse cuando se enfrenta a una nueva estrategia de
control. En ciertos lugares (Norteamérica y Europa) esto
ocurre por la recombinación sexual mientras que en otros
sitios donde no hay recombinación sexual, por mutación
o mecanismos parasexuales. Como resultado de esta
plasticidad del patógeno, existen muchos genotipos
distintos en diferentes partes del mundo.
En general, los investigadores creen que mientras más se
conoce la ubicación y naturaleza de estos genotipos de P.
infestans mejor se puede diseñar estrategias de
control de la enfermedad. Por este motivo, se han
dedicado muchos recursos a la identificación de
marcadores moleculares que permitan hacer una
clasificación (fingerprint) de cada cepa
encontrada. Uno de los marcadores que ha sido de
mayor utilidad es de tipo RFLP (restriction fragment
length polymorphism). La sonda R657, ha sido utilizada
por muchos investigadores. Como resultado, hoy en
día hay un gran número de "fingerprints"
basado en R657. Recientemente muchos de estos
fingerprints han sido compilados en una base de datos que
está accesible vía Internet
(http://mgd.orst.edu/hyperSQL/phytoph/index.html).
La comparación de diferentes fingerprints provenientes
de distintas partes del mundo ha permitido la
elaboración de interesantes hipótesis sobre la
filogenia e historia del patógeno. Una de las más
importantes propuestas ha sido la que un solo linaje
clonal existía en casi todo el mundo hasta más o menos
los años 80. Un análisis de cepas del patógeno
de más de 10 países mostró que todas tenían ya sea el
mismo fingerprint o un fingerprint muy parecido a los
demás. El linaje se denominó "US-1" y
el genotipo prototipo lleva el mismo nombre. Este
descubrimiento tiene significancia, por lo menos
teórica, para el control de la enfermedad.
Aparentemente la base genética del patógeno fue muy
reducida en la mayoría de los países. Hasta ahora la
enfermedad ha sido devastadora y la introducción de
nuevo germoplasma desde el centro de origen del patógeno
(México) puede empeorar la situación.
Otra utilidad de los marcadores RFLP es en la
identificación de genotipos relacionados con ciertos
hospederos. En Norteamérica se ha identificado un
genotipo (US-8) que ataca tanto al tomate como a la
papa. En Africa, se identificaron genotipos
diferentes asociados con cada cultivo.
Esta diferenciación se basó principalmente en patrones
de aloenzimas, que son otros marcadores
importantes. Al analizar el patógeno con RG57, se
vio que
|
|