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- Así como
en otro tipo de marcadores, algunas bandas son
fácil y claramente interpretadas, en tanto que
otras son ambiguas. Esta ambigedad puede
deberse a:
1) Bajo poder de
un cebador específico de discriminar entre sitios de
amplificación distintos.
2) De la competición entre diferentes sitios de
amplificación por sustrato o enzima, de manera que
la presencia de ciertos segmentos puede interferir con la
amplificación de otros, en proceso equivalente a una
interacción "epistática" entre marcadores que
influye en el fenotipo final de las bandas.
3) De problemas relacionados con la estandarización de
las condiciones de amplificación. Se han observado
variación de resultados de laboratorio a laboratorio.
- El uso de
RAPDs para análisis filogenéticos,
"fingerprinting" y determinación de
paternidad debe ser hecho con criterio, una vez
que la competición entre diferentes segmentos
puede llevar a resultados ambiguos. La
estandarización de protocolos para la
resolución de RAPD es un paso importante.
El componente
responsable del 80% del costo total de un dato
genotípico (data point) se debe a la enzima Taq
polimerasa. El costo de producción de esta enzima es
por lo menos 3 veces menor al costo del mercado. Se
espera que en los próximos años, el costo caiga
substancialmente de igual forma que ocurrió con las
enzimas de restricción.
Welsh,
J. , McClelland, M. (1990) Fingerprinting genomes
using PCR with arbitrary primers. Nuc. Acid. Res. 18:
7213-7218.
Williams, J. , Kubelik, A. , Livak, K. ,
Rafalsky, J. , Tingey, S. (1990) DNA
polimorphisms amplified by arbitrary primers are useful
as genetic markers. Nuc. Acids Res. 18: 6531-6535.
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