|
VENTAJAS DE LOS
MARCADORES RAPDs
- Se requiere
una mínima cantidad de ADN para el análisis
genotípico de un individuo
- RAPDs se
basa en la amplificación del ADN, que resulta en
una serie de ventajas prácticas que pueden ser
resumidas en dos atributos: simplicidad y
rapidez.
- La técnica
RAPDs no requiere del desarrollo previo de una
biblioteca de sondas específicas para un
organismo de interés eliminando la necesidad de
marcación radioactiva.
- La técnica
RAPDs permite generar gran cantidad de
polimorfismo de segmentos de ADN distribuidos por
todo el genoma del organismo. Por lo tanto,
ofrece la posibilidad de mostrar regiones de ADN
repetitivo, una vez que los cebadores utilizados
para la detección de variación son arbitrarios.
- RAPDs es
mucho más sensible en la detección de
polimorfismo a nivel de ADN por tanto es adecuada
para la construcción de mapas genéticos a nivel
intra-específico, identificación de genotipos y
obtención de "fingerprints"
genómicos.
- RAPDs
constituye una técnica alternativa de clonaje de
segmentos genómicos, extremadamente simples y
eficiente.
- El costo de
la técnica es bajo comparativamente con otras
técnicas.
- Es una
técnica bastante accesible ya que su uso no
requiere experiencia profunda en Biología
Molecular y tampoco instalaciones sofisticadas de
laboratorio.
LIMITACIONES DE LOS MARCADORES RAPDs
- La
principal limitación de los RAPDs es el bajo
contenido de información genética por locus.
Apenas un alelo por locus es detectado (por
segmento amplificado) en cuanto que las demás
variaciones alélicas son clasificadas como un
alelo nulo. Excepción hecha para alelos
co-dominantes resultantes de pequeñas
inserciones o deleciones en locus RAPDs. Los
genotipos heterocigotos no pueden ser
directamente discriminados de los homocigotos por
la técnica RAPDs. Esta limitación es
comúnmente descrita como "dominancia"
de los RAPDs.
- Otro
aspecto que puede ser considerado como limitante
en algunos casos, es el desconocimiento previo de
la base genética de las bandas RAPDs. Es decir,
una banda RAPDs observada en el gel solo puede
ser considerada como un marcador de
comportamiento Mendeliano después de verificada
su segregación en los descendientes. Por tanto
es importante resaltar, que este prerrequisito es
necesario en principio, para cualquier marcador
molecular.
- El alto
poder de detección de polimorfismo, en algunos
casos puede limitar la capacidad de hacer un
análisis en individuos genéticamente distantes.
Esto se torna más pronunciado a medida en que la
distancia genética entre dos individuos
analizados aumenta, como resultado de diferencias
en frecuencias génicas para los alelos
amplificados entre poblaciones.
|
|